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easypubmed's Introduction


EasyPubMed

EasyPubMed使新版PubMed更好用

EasyPubMed使用说明(中文版)

如Github网站图片加载出现问题，可访问知乎获取相同内容

更新至Version 0.0.5（2020.8.2）：更新日志

  • 进一步修复2020/7/17 由于Pubmed网站更新所致无法显示IF、JCR及CAS分区的问题
  • 支持https://sci-hub.ren作为sci-hub URL
  • 修复弹出页面版本号错误问题

EasyPubMed makes New PubMed easy to use

EasyPubMed User Manual(English)

功能特色

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  • 特色工具条，专为新版PubMed设计

  • 通过Edge及Chrome商店审查，无需开发者模式，安全放心

  • 极速加载：采用本地数据库，平均加载时间<0.1s

  • 一键点击从Sci-Hub获取全屏全文PDF

  • 显示杂志影响因子

  • 显示杂志JCR分区或中科院分区

  • 一键获取BibTex格式文献信息

English version: Functions and Features
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安装

浏览器支持: Chrome, Edge

目前Google及Edge应用商店均已通过应用商店安全审查，您可以通过Chrome及Edge商店直接添加此扩展0.0.4版本（采用2020年JCR数据）。欢迎反馈

Edge版本地址为https://microsoftedge.microsoft.com/addons/detail/easypubmed/daibhooimgnmhjagkkjamadijfambhid

Chrome版本地址为（国内访问需使用代理）https://chrome.google.com/webstore/detail/easypubmed/nkpdpmomjhifdobiopmgfjjffacldfje?hl=en

目前最新版本EasyPubMed v0.0.4（使用2020年JCR数据）已上传至Github，您可以通过开发者模式使用。方法如下

  1. 下载扩展插件: 点击此链接EasyPubMed，点击download按钮下载EasyPubMed.zip文件。国内如无法下载可以通过此链接EasyPubmed(国内)下载
  2. 解压缩EasyPubMed.zip文件（选择‘解压到当前文件夹’即可）生成EasyPubMed文件夹
  3. 打开chrome或edge浏览器，在导航栏输入chrome://extensions（Chrome浏览器）或edge://extensions（Edge浏览器），确保开发者模式打开，点击‘加载解压缩的扩展’按钮，选择EasyPubMed文件夹即可加载成功。

English version: Setup
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功能展示

EasyPubMed工具条

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安装EasyPubMed后，每篇文献下方将会出现EasyPubMed工具条

  1. EasyPubMed图标：链接到EasyPubMed在Github上的主页

  2. 显示杂志JCR分区或中科院分区（可在弹出界面设置）

    • JCR分区: 采用最新2020年 Journal Citation Reports数据，所显示的分区为该杂志在SCIE所用学科类别中的最佳排名。 比如，该杂志在A学科中排名Q1，在B学科中排名Q3，那么依据其最佳排名该杂志被标注为Q1。不同分区杂志采用不同颜色标注，Q1标注为红色，Q1标注为黄色，Q3标注为绿色，Q4标注为灰色。NA表示该杂志未被收录。
    image-20200621180515339
    • CAS分区：采用2019年12月26日发布的中科院（CAS）文献情报分区表，所显示的分区为该杂志在所用学科类别中的最佳排名。我们采用B1、B2、B3、B4表示该杂志在1区、2区、3区、4区。不同分区杂志采用不同颜色标注，B1标注为红色，B1标注为黄色，B3标注为绿色，B4标注为灰色。NA表示该杂志未被收录。
    image-20200621181012739

  3. 显示杂志影响因子: 采用最新2020年 Journal Citation Reports数据，NA表示该杂志未被收录。

  4. 链接至该文章所对应的Sci-Hub页面。如果未找到该杂志doi，此链接将失活变为灰色。

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  1. 全屏显示全文PDF，这是通过进一步分析Sci-Hub页面所获得的全屏PDF链接，可能需要几秒钟加载时间。如果可以获取全文PDF，此链接将被激活并显示'PDF(Full Text)‘，否则连接将变成灰色并显示'PDF(NOT FOUND)'。

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  1. 用BibTex格式展示该文章信息。该信息通过访问NCBI数据库分析得到，可能需要几秒钟时间，如果获取失败将有提示出现。可以点击下方按钮选择保存此信息为txt文件或复制到剪贴板。下载文件的文件名及该文章BibTex编号为：PMID+该文章PMID号+一作姓氏+出版年份，如'PMID32109013_Guan_2020'。

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弹出页面

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左键点击浏览器右上角深蓝色EP（EasyPubMed）按钮将会出现弹出页面，您可在此页面进行参数设置、快捷功能访问并了解EasyPubMed使用。

  1. 设置默认Sci-Hub地址，默认为 'https://sci-hub.tw/'. 合法的Sci-Hub地址需由 'https://' 或 'http://' 起始并由 "/"结尾.
  2. 选择展示JCR分区或CAS分区。如果一种方法被激活，另一种分区方法将自动关闭。默认采用JCR分区。
  3. 恢复到默认设置即Sci-Hub地址： 'https://sci-hub.tw/ 并展示JCR分区.
  4. 链接到PubMed首页: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/
  5. 链接到您设置的Sci-Hub首页：默认为 'https://sci-hub.tw/
  6. 搜索Sci-Hub网站。您可以在此处输入所寻找文章的PMID号、DOI或论文题目，在此处搜索与在Sci-Hub首页搜索所得结果是一致的。
  7. 链接到EasyPubMed使用手册
  8. 链接到EasyPubMed错误报告及建议页面
  9. 链接到捐助页面
  10. 了解扩展开发故事及作者
  11. EasyPubMed版本号及作者信息

English version: Details
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数据来源

采用杂志唯一的ISSN编号将Pubmed数据库杂志信息、2020年JCR报告、2019年12月26日发布的中科院（CAS）文献情报分区表合并。我们采用Pubmed杂志缩写获取各杂志的影响因子、JCR分区及CAS分区。结果已经过手动核查。但由于JCR及CAS报告可能错误的将eISSN用作ISSN，因此合并过程可能出现错误。如果您发现数据有误，您可以通过发送邮件到[email protected]或在https://github.com/naivenaive/EasyPubMed/issues中发起新提议以将错误信息报告给我们.

既往问题：

由于NLM的问题（已将此问题汇报给NLM），以下杂志使用了相同的Pubmed杂志缩写，使用时请引起注意。

  • Pubmed杂志缩写: Front Phys
    • Frontiers of Physics (ISSN:2095-0462; IF:2.483; Q2; B2)
    • Frontiers in Physics (ISSN: 2296-424X; IF:1.895; Q2; B3)
  • Pubmed杂志缩写: Microbiology
    • Microbiology (Reading, England) (ISSN: 1350-0872; IF:1.922; Q4; B4)
    • Microbiology (ISSN: 0026-2617; IF:1.027; Q4; B4)

此问题已得到NLM反馈并解决，以下为回复邮件引用

The following changes have been made:

MedAbbr for Frontiers of physics (NLM UI 101600789) changed to: Front Phys (Beijing)

MedAbbr for Microbiology (NLM UI 0376646) changed to: Microbiology (N Y)

English version: Data source
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声明

EasyPubMed及其作者不对此扩展所提供数据（包括JCR杂志影响因子、杂志JCR分区、杂志CAS分区、文章BibTex信息）准确性及 Sci-Hub全文数据来源及准确性负责。如果您希望获取JCR影响因子、杂志JCR分区，请访问JCR官方网站: https://jcr.clarivate.com/. 如果您希望获取中科院（CAS）文献情报分区，请访问: http://www.fenqubiao.com/.

English version: Data source
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隐私

该扩展不收集任何可以确定您身份的信息。该扩展使用您所访问的PubMed (https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/) 网站中所获得文章的相关信息。该扩展会将您所设定的默认Sci-Hub地址及选择展示JCR或CAS分区的默认选项存入到本地存储中。以下信息可能涉及到您的个人信息：

  • 您所访问的PubMed网站中所获得文章的相关信息：该扩展通过分析网站中展示的文章信息获取各文章doi号码并将号码传递到后台。在后台，扩展匿名地通过doi号码访问您所选择的Sci-Hub网址 (https://sci-hub.tw/, https://sci-hub.st/, https://sci-hub.se/, https://sci-hub.ee/或https://sci-hub.ren/) 以获取该文章是否在Sci-Hub中存在全文。该信息被传递到前台以激活或失活“Full-text"按钮的形式显示在页面中。在此过程中未传递您的任何私人信息。

EasyPubMed尊重您的的数据隐私。您任何私人信息均未被搜集、分享、上传或向第三方披露。如有任何有关数据搜集及隐私方面的问题，您可以随时联系[email protected]。

English version: Privacy policy
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错误报告及建议

我们正在为此扩展增添更多功能，如果您有想法或建议请告知我们。如果您发现数据错误请告知我们。您可以通过发送邮件到[email protected]或在https://github.com/naivenaive/EasyPubMed/issues中发起新提议以将错误信息报告给我们。非常希望得到您的反馈。

English version: Bug report and suggestion
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捐赠

EasyPubMed是完全免费的。此扩展开发过程需要耗费很大的时间和精力，如果您觉得此扩展有用、好用，能否请作者吃一份烤冷面（10元），喝一杯咖啡（20元），一盘锅包肉（50元）或一顿美味的海底捞（100元）呢？我将深受鼓舞并尽力维护好此项目。

image_20200623115902.jpg

English version: Donation
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开发故事

我是一名医学生，经常使用Pubmed查阅文献。几年前，我发现了名为Pubmedy的扩展插件。该插件帮助我节省了大量查阅全文的时间。尽管此插件非常好用，但是2018年就停止更新了。2020年5月Pubmed停止了对旧版本的支持并以新版本替代，自此Pubmedy插件再也不能使用。在使用新版本Pubmed过程中，没有此插件的帮助我感觉很不适应。此外，我经常需要用到BibTex格式的文件，而Pubmed并不直接提供此种格式的下载。因此，我决定制作一个为新版Pubmed设计的新插件。

作为一名医学生，我对于编程仅限于用R、Python进行数据处理，我完全不了解如何编写这样的插件。在我下定决心后，我开始自学 JavaScript，CSS及 HTML前端开发知识。以原Pubmedy插件作为老师，结合自学内容在克服了重重困难后成功制作了该插件。它的性能稳定，加载速度很快。希望您能觉得此插件有用。当然，由于水平有限，制作过程中难免会出现一些bug，希望您可以将您的体验及所发现的错误报告给我[email protected]，我将非常感激。

English version: Developing story
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作者

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田振

经历

  • 2010-2015：上海交通大学医学院就读临床医学

  • 2015-2018：复旦大学上海医学院就读；华山医院皮肤科住院医生

  • 2018-今：自由职业，等待机会与希望，愿神保佑

兴趣爱好

  • 聊人生和希望
  • 皮肤病诊疗 (银屑病、痤疮、脱发等), 医疗美容 (护肤品、激光等)
  • 医学科普
  • 医学统计及生物信息学，使用R、Python处理医学相关数据
  • 最近喜欢前端编程（JavaScript，CSS，HTML）开发扩展

如果您和我有相似的兴趣，或者您遇到困难觉得我的兴趣爱好可能对您有所帮助，或者您有一些兼职工作如医学材料翻译、医学科普制作等我可以帮助完成，亦或您单纯想同我聊一聊人生和希望，欢迎与我联系。

联系方式

English version: Author
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