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basic's Introduction

계량약리학 워크샵 - 초급 과정

본 도서는 부크크(bookk.co.kr), 알라딘(aladin.co.kr), YES24(yes24.com)에서 "계량약리학 워크샵"으로 검색하여 구입할 수 있습니다. (ISBN 979-11-372-1390-6)

도서 정보

혼합효과 모델링(mixed-effects modeling)은 신약개발과 임상시험, 시판허가 등의 주요 의사결정에 필수적으로 쓰이고 있는 계량약리학적 접근법의 핵심적인 기법으로서 그 기본개념을 익히는 것이 결코 쉽지 않습니다. 2009년부터 매년 개최해 온 PK/PD 워크샵의 내용 중에서 basic-1과 2의 교재를 입문자들이 스스로 학습할 수 있도록 한권의 책으로 펴냈습니다. 약동-약력학 모델링을 위해 가장 널리 사용하는 NONMEM 소프트웨어를 활용하기 위에 알아야 하는 기본개념들과 그 사용법을 소개합니다.

목차

  • I. 모델 구축의 기초
    • Chapter 01 계량약리학과 관련 개념들 - 임동석
    • Chapter 02 NONMEM 데이터셋 - 이소진
    • Chapter 03 모델 유형 별 NONMEM 제어구문 소개 - 배수현
    • Chapter 04 특수 ADVAN을 이용한 control stream의 코딩 - 전상일
    • Chapter 05 일반 ADVAN을 이용한 control stream의 코딩 - 홍태곤
    • Chapter 06 기타 ADVAN - 임동석
    • Chapter 07 $PRED: ADVAN을 쓰지 않는 코딩 - 임동석
    • Chapter 08 초기추정값 - 한승훈
    • Chapter 09 파라미터 추정 방법 및 세팅 - 김정렬
    • Chapter 10 NONMEM 실행결과 해석 및 Xpose4 사용법 - 전상일
    • Chapter 11 공변량 분석 - 한승훈
  • II. 모델 진단 및 약동학-약력학 연계 모델
    • Chapter 12 모델 진단평가 개론 - 한승훈
    • Chapter 13 모델 적합 상태에 대한 진단 - 전상일
    • Chapter 14 NONMEM의 $COVARIANCE - 배균섭
    • Chapter 15 모델 파라미터의 적절성 - 전상일
    • Chapter 16 모델의 예측성능 평가 - 한성필
    • Chapter 17 약동-약력(PK-PD) 모델링의 이론적 기초 - 임동석
    • Chapter 18 약동,약력학 연결 방법 - 이소진
    • Chapter 19 다양한 약물효과 모델 - 배수현
    • Chapter 20 지연효과 모델 - 김정렬, 임동석

저자 소개

임동석, MD, PhD
가톨릭의대 약리학교실

이소진, PharmD
Q-fitter

배수현, PhD
Q-fitter

전상일, MD, PhD
Q-fitter

홍태곤, MD, PhD
서울부민병원 임상시험센터

한승훈, MD, PhD
가톨릭의대 약리학교실

김정렬, MD, PhD
삼성서울병원 임상약리학과

배균섭, MD, PhD
서울아산병원 임상약리학과

한성필, MD, PhD
가톨릭의대 약리학교실

PIPET

가톨릭계량약리학연구소, Pharmacometrics Institute for Practical Education & Training

임상약리학의 중추적 영역인 계량약리학(Pharmacometrics) 분야를 주요 연구 주제로 하는 우리나라 최초의 연구소로 2014년 개소하였습니다. 가톨릭의대 약리학교실 소속의 임상약리학 분야 교수진은 이전에도 다수의 계량약리학 관련 연구 및 산학연계 프로젝트 등을 수행하고 있지만, 국내 신약 개발 산업 확대, 임상 상황에서 개인별 약물요법의 중요성 증대 등 급증하는 계량약리학 수요에 부응하고자, 보다 선진적인 서비스 제공 및 신뢰성 있는 전문가 양성이라는 목적으로 PIPET을 설립하게 되었습니다.

현재 PIPET은 계량약리학 연구 방법론 개선, 선진 계량약리학 기법 도입, 사용자 친화적 계량약리학 소프트웨어 개발, 신약 개발 및 임상 상황에서 약물 요법에 대한 정량적 근거 마련 등의 업무를 수행하고 있으며, 학위 과정, 제약사 인력 교육 프로그램, 주기적 계량약리학 워크샵 개최 등을 통해 전문가를 적극 양성하고 있습니다.

또한, 서울성모병원 임상약리과와 함께 데이터 확보와 해석이 동시에 이루어질 수 있는 효율적인 연구 체계를 구축하고 있으며, 이를 기반으로 국내 신약 연구 및 약물요법 개선을 위해 노력하고 있습니다.

Author Guidelines

편집 관련

  1. Rmarkdown (*.Rmd) 형식으로 원고를 작성합니다. 01.Rmd, 02.Rmd, 03.Rmd 등으로 파일 이름을 작성합니다.
    • 마이크로소프트 워드를 사용할 수도 있으나 pandoc을 사용하여 변환하는 과정을 거쳐야 하므로 피치 못할 경우에 사용한다.
  2. 그림 파일은 파워포인트로 작업하여 pdf 형태로 저장하는 것을 우선시 합니다.
    • 폰트는 Arial, 나눔고딕을 선호합니다.
  3. 표 파일은 엑셀로 작업하여 csv 형태로 저장하는 것을 우선시 합니다.
    • 복잡한 표 형태에 대해서는 kableExtra 패키지를 사용해야 합니다.
    • 예: 표에서 Footnote 사용: 03.Rmd

Adobe Acrobat Pro DC를 통한 부크크 전달 파일 생성

  • LaTeX krantz.cls를 통해 제작된 pdf 파일의 크기는 A4입니다.
  • Trim Mark 등을 제거하고, A5 (148 x 210 mm, 148/210 = 0.705) 와 같은 비율을 얻어야 합니다.
  • 이를 위해 177 x 252 mm, 177/252=0.702의 Adobe Acrobat DC (접속정보: [email protected] / P*7!)을 사용합니다.
  • Crop margin - final : 14 31 13 20mm (홀) 14 31 20 13mm (짝) 각각 전체 페이지에 적용합니다.
  • (부크크용 PDF 제작시에만 적용) 이후 A5 용지로 PDF 프린트 하며, 80% 비율로 프린트 한다.

Cover 제작용 비율

(back <- 16.235) # 268 페이지
(width <- 3+100+148+back+148+100+3)
(height <- 3+210+3)

(width <- 3+100+148+back+148+100+3)
# [1] 518.235
(height <- 3+210+3)
# [1] 216
width/height
# [1] 2.399236

basic's People

Contributors

shanmdphd avatar

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basic's Issues

그림 16.1 오기 말씀드립니다.

안녕하세요, 서울아산병원 임상강사 선우정입니다.

  1. 그림 16.1의 밑 부분에 96% CI라고 되어있어서 95% CI로 수정해야 할 것 같습니다.
  2. 19.1.4에 아래와 같이 오타가 있습니다.
    image
  3. 식 19.16도 수정되어야 할 것 같습니다.
    image

감사합니다. 선우정 드림

12.2단원에서의 오기 말씀드립니다.

안녕하세요 선생님, 서울아산병원 임상강사 선우정입니다.
12.2단원에서 오기 말씀드립니다.

12.2.1 적합도의 확인 방법
image
'일반적으로' 또는 '일반적인'이라고 수정해야 할 것 같습니다.

12.2.2 파라미터의 정확성과 정밀성
image
'overparameterization'으로 수정해야 할 것 같습니다.

감사합니다. 선우정 드림

grep: ω2과 σ2에서 위첨자

grep -rl 'ω2' ./*.Rmd
grep -rl 'σ2' ./*.Rmd

grep -rl 'ω2' ./*.Rmd | xargs sed -i 's/ω2/ω^2^/g'
grep -rl 'σ2' ./*.Rmd | xargs sed -i 's/σ2/σ^2^/g'

표/그림 오류

  • 표 4.2: bold처리 안됨
  • 표 4.3: bold처리 안됨
  • 표 18.1 - valign 동작 안함
  • 표 18.2 - Bold체 처리 안됨
  • 10장의 그림 수정
  • 표 4.5 - 스페이스 있어야
  • 그림 5.2 - 그림 속의 글자들을 조금 크게 또는 가늘게 하여 가독성 높여야

image

  • [V] 그림 5.5 SCI 제거

image

  • 표 17.1 글자가 표에서 벗어남
  • 그림 17.2 slope가 노란 직선과 같아야 함

image

정오표

초판 1쇄 Ver.20200731 기준

  • 2020-08-01
  • 2020-08-02
    • 별첨 A: 제목: 아웃풋 -> 실행결과 ✍️ @shanmdphd
    • 저자 페이지 대신 첫 페이지에 Ver 표기하도록 변경 ✍️ @shanmdphd
  • 2020-08-04
    • 3장 (30쪽): $OMEGA 0.02 0.01 0.02 -> $OMEGA 0.02 0.02 ✍️ @shbae1211
    • 3장 (30쪽): $TABLE ID WT AGE SEX HT ALB CLCR -> $TABLE ID WT SEX HT ALB CLCR ✍️ @shbae1211
    • 3장 (30쪽): 위의 식 @red(eq:scalingparam)에서 좌변에 -> 위의 식 3.1에서 좌변에 ✍️ @shbae1211
    • 3장 (48쪽): 코드 3.8 $EST PRINT=5 MAX=9999 SIG=3를 코드 맨 뒤로 이동 ✍️ @shbae1211

2쇄 Ver. 20200804 기준

  • 2020-08-12
    • 11장: 124쪽: 11.2.4.1 -> 11.1.4.1 ✍️ @shanmdphd
    • 14장: 151쪽: 14.5를 참고한다 -> 14.6을 참고한다. ✍️ @ksbae
    • 14장 153쪽: 수식 14.3 -> i를 삭제 ✍️ @ksbae
  • 2020-08-13
    • 1장: tij를 tij로 변경 ✍️ @shanmdphd
    • 3장: 코드 3.4~3.6 THATA -> THETA ✍️ @swj4991
    • 3장: UNCONTIONAL -> UNCONDITIONAL ✍️ @swj4991
    • 3장: 2구획 경구 약둉학 데이터를 -> 2구회 경구 약동학 데이터를 ✍️ @swj4991
  • 2020-08-19
    • 8장: ωi2 -> ωi2 ✍️ @swj4991
    • 8장: 8.6 | e2 -> e2 ✍️ @swj4991
    • 10장: parametrization -> parameterization ✍️ @swj4991
    • 10장: w2 -> w2 ✍️ @swj4991
    • 11장: 11.1.4.1 | wi2 -> wi2 ✍️ @swj4991
  • 2020-08-20
  • 2020-08-21

3쇄 Ver.20200821 기준

Co-authored-by: Sunwoo, Jung <[email protected]>
Co-authored-by: Choi, Suein <[email protected]>

원고 수정 및 해야할 일

부크크 원고 수정

  • Ver.202009UK 4쇄 작업중 ('9월 원고수정일은 11일, 25일 입니다')
  • Ver.20200821 3쇄 : 원고수정료 5000원 수익금으로 결제
  • Ver.20200804 2쇄 : 원고수정료 5000원 수익금으로 결제
  • Ver.20200731 초판 1쇄
  • 원칙
    • 원고 수정비는 책 한권당 5,000원입니다.
    • 결제가 완료되면 파일업로드&상태조회 페이지에서 원고와 표지이미지를 업로드하실 수 있습니다.
    • 작업 진행은 영업일 기준(휴일, 주말 제외) 당일 정오(오전 12시)까지 결제와 원고파일이 업로드 되어야 가능합니다.

해야할 일

  • 일부 장은 서론이 있고 일부는 없습니다: (서론 대신 소개라고 되어 있기도 합니다.) 9, 20장은 바로 본론 소제목내용이 들어감.
  • 소제목이 없는 경우가 있습니다: 10장은 소제목이 없음
  • assets 폴더 정리할 것
  • 75,76쪽 Figure 저작권 관련 다시 그리기
  • Index 에서 MSF 중복되어 있음

참고사항

image

오탈자인 것 같아서 적습니다.

안녕하세요!
PBPK만 알다가, popPK 를 공부하고 있는 김민수 입니다.

popPK에 대한 설명이 한국어로 (모국어가 아무래도 빨리 읽히네요..) 너무 잘 되어 있어서 보기 시작했습니다. 오탈자 보고 전에 감사 드립니다.

  1. 첫 번째 오탈자는 그림 번호에 대한 것입니다.
    웹 페이지 http://pipet.or.kr/books/basic/intro.html 내용 중에 "그림 1.5의 사례에서 쓰인 약물은 CL의 경우 GFR과 같은 공변량의 함수로(그림 1.6에서는 선형적으로 비례) 예측할 수 있으나, 실제 어떤 환자 i에서의 CL은 그의 GFR로 예측한 값보다 더 컸고 이는 그 환자에서의 CL의 개인간차(ηCLi)가 양의 값을 가진 것으로 설명한다(그림 1.6의 왼쪽부분)." 라는 문장 중 그림 1.5의 사례는 그림 1.6의 사례`의 오타인 것 같습니다. 그림 1.5는 체중을 여러번 측정한 사례를 이용해서 eta와 epsilon을 설명하고 있습니다.

  2. 두 번째 오탈자는 아랫첨자에 대한 것입니다.
    웹 페이지 http://pipet.or.kr/books/basic/intro.html 내용 중에 "원인을 한가지로 특정할 수 없지만, 까만 원과 흰 네모 사이의 거리는 파라미터의 개인간차로 설명이 안되는 부분이라서 잔차(ε)라고 하며, 실제 모든 사람에서 각 측정치마다 따라다니는 값이므로 각기 다른 사람임을 나타내는 i와 측정횟수를 의미하는 j를 아래첨자로 함께 붙여서 εij로 표기하게 된다." 라는 내용이 있습니다. 여기서 내용상 εij의 ij는 아랫첨자로 쓰여야 할 것 같습니다 (εij). 사소한 내용일 수도 있는데, 다른 표기들은 모두 아랫첨자를 신경써서 하신 것 같아서 적습니다.

  3. 그리고 같은 페이지의 ηVdi 표기가 맨 마지막 줄에는 폰트가 조금 다른 (수식 기능으로 작성된 것인지요?) 모양인데, 의도된 것이라면 하나로 통일하는 것이 좋지 않을까 싶습니다 (ηVdi).
    image

오탈자 보고가 처음이라서 혹시 제가 보고하는 양식에 맞게 쓰지 않았다면 너그럽게 알려주시면 고치겠습니다.

많이 수고스러운 작업이셨을 것 같은데, 좋은 자료 공유해주셔서 감사합니다!

김민수 올림

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