philsf-biostat / analise_dados_vb_2016 Goto Github PK

Para visualizar as tabelas online no github, é necessário que as tabelas estejam formatadas de forma compatível com o GFM.

Descobri que o pandoc precisa ser configurado para output no formato rmarkdown.

Com isso, as tabelas precisam ser refeitas.

Damn, falta de reprodutibilidade!

Gerar figuras (em geral barplots), categorizando as variáveis por técnica cirúrgica:

• Dor imediato (0:10) x técnica
• Dor Tardio (0:10) x técnica
• Remifentanil x técnica
• Tempo de cirurgia x técnica

Criar um relatório com

• metodologia estatística
• figuras dos gráficos
• tabelas descritivas (com p-valores dos testes)
• trecho explicando a interpretação dos p-valores

Atualizar as TCs para os dados corrigidos.

Para saber se o Tempo de cirurgia e/ou o tratamento anestésico são fatores que influenciam a dor no período imediato, talvez o caminho seja fazer uma análise de regressão.

Como a variável resposta (dor) é ordinal, talvez não seja apropriado fazer uma regressão logística comum, e sim uma regressão ordinal. Isso parece estar implementado no pacote ordPens.

Estudar:

• http://stats.stackexchange.com/questions/77796/coding-for-an-ordered-covariate
• http://stats.stackexchange.com/questions/33413/continuous-dependent-variable-with-ordinal-independent-variable
• http://andrewgelman.com/2009/10/06/coding_ordinal/

Recebi uma nova planilha com dados de 2 novos pacientes.

• Padronizar estes dados
• incluir na tabela
• refazer os gráficos e análises com o dataset completo

Incluir as tabelas e figuras da versão v0.10.1 no README.

A partir das tabelas de contingência atualizadas, gerar as figuras (barplots)

Tabelas descritivas dos dados numéricos e categóricos

Numéricas

• Idade: média (min - max)
• IMC: média (min - max)

Categóricas

• Gênero
• ASA

• Atualizar a Metodologia para versão atual do R.
• Listar testes utilizados

Por padrão o R ordena os factor levels alfabeticamente. Isso não é aceitável para a exibição dos resultados.

• Os tempos devem ser em ordem crescente (Curto, Médio e Longo)
• Os escores de dor devem ser em ordem crescente (Ausente, Leve, Moderada, Intensa)

Para organizar o fechamento do repo, criar os releases, e oferecer os ZIPs.