В разделе по поднятию кластера с несколькими шардами по mongo есть еще одна серьезная, на мой взгляд, ошибка, которая связана с созданием коллекции.

Есть команда:
docker exec -it mongos1 bash -c 'echo "db.createCollection("someDb.someCollection")" | mongosh'

Эта команда создает коллекцию. Как видите тут в наименовании коллекции стоит "someDb.someCollection" - то есть вы можете подумать, что коллекция создастся для базы someDB, но это не так. Если посмотреть в документации на эту функцию, то там первый параметр - это просто ИМЯ коллекции. То есть этой командой вы создадите коллекцию, которая НАЗЫВАЕТСЯ someDb.someCollection, а теперь угадайте, к какой базе она будет принадлежать?
По умолчанию, если мы в запускаем mongosh, то он находится в контексте базы test. То есть выполнив команду мы создадим коллекцию someDb.someCollection для базы test.

Почему это незаметно при работе? потому что следующая команда

docker exec -it mongos1 bash -c 'echo "sh.shardCollection("someDb.someCollection", {"someField": "hashed"})" | mongosh'

делает коллекцию шардируемой. И если заглянуть в документацию, то там мы передаем не ИМЯ коллекции, а пространство имен. То есть тут действительно идет сначала база, потом, через точку, название коллекции.
То есть шардировать вы начинаете нужную коллекцию) А так как в случае отсутствия какой-то сущности монга ее просто создает, то при работе из питончика вы даже не заметите, что коллекцию создали в другой базе, потому что в питончике вы задаете нужные вам базу и коллекцию этой базы и они автоматически создадуться и будут уже шардируемыми (как я понял)

В качестве альтернативы можно использовать вот такую команду:
docker exec -it mongos1 bash -c 'mongosh < /scripts/setup-collections.js'
где в /scripts/setup-collections.js можно задать контекст базы данных и уже для нее создать коллекцию

ждать исправлений тут