institut-zdravotnych-analyz / covid19-data Goto Github PK

budete davat nejaky daily dataset aj z Ag testov prosim?

Dobrý deň, v súbore OpenData_Slovakia_CovidAutomat.csv sú názvy okresov trochu porozbíjané.

Napríklad okres Stará ?ubov?a alebo ?adca. V hex editore vidím všetky tie otáznikové znaky ako 3F (00111111), čo je naozaj otáznik v ASCII.

V súbore OpenData_Slovakia_Covid_Hospital_Details.csv sa nachádzajú čísla ako 522727272727273, 416666666666667, 133333333333333. Možno nesprávne miešanie dátových typov niekde na pozadí?

Pôvodnú issue otvoriť nemôžem kvôli nastaveniam práv v repozitári, preto otváram novú. Issue #19 zatiaľ nebola nijak reflektovaná, požiadavky na otvorené dáta o očkovaní u nás sú čoraz častejšie.

denne je vela testov nepriradenych okresu ("Neznáme", "NA"), ci uz total pocet testov, alebo aj pozitivnych, ako s tym narabat? je nejaky pattern za tym ako to je kategorizovane?

Hi, thanks for collating this data!

Dates in the file OpenData_Slovakia_Covid_Deaths_AgeGroup_District .csv (same thing in the Excel) display as integers starting in December, 2020.

Im dealing with this in the following way (R):

library(readr)
library(lubridate)
library(tidyverse)

c_as_date <- function(x){
  as.Date(as.integer(x), 
          origin = "1899-12-30")
}
# example:
# c_as_date("44166")
#  "2020-12-01"

DeathsIn <- read_delim("https://raw.githubusercontent.com/Institut-Zdravotnych-Analyz/covid19-data/main/OpenData_Slovakia_Covid_Deaths_AgeGroup_District.csv", 
                col_types = "ccccc",
                delim=";",
                locale = readr::locale(encoding = "windows-1250")) %>% 
  mutate(Date1 = suppressWarnings(dmy(Date)),
         Date = case_when(is.na(Date1) ~ c_as_date(Date),
         TRUE ~ Date1)) 

You may wish to have a look at these files sometime.

Dobrý deň,

chcel by som som sa spýtať, ako funguje zverejňovanie datasetu Antigénových testov. Všimol som si, že k dennej aktualizácie týchto dát prichádza okolo poobedných hodinách a vždy je najnovší deň nových testov, deň aktualizácie.

Je to iba o deň posunuté alebo ide už aj o dáta z dňa aktualizácie?

Ďakujem

Hi again,
Thanks for this data! I'd like to transform this file into a cumulative time series by age, sex, and region. However, the earliest date given is in September, 2020. To do this, one either needs the same time series starting from early 2020, or else a snapshot of the cumulative (over time) age-sex distribution by regions sometime since last September. Has the earlier part of this file been removed for size reasons? Is there another way to obtain it?
Many thanks for any guidance,

Súbor s úmrtiami podľa veku a Okresu obsahuje len 2969 záznamov , v súčastnosti je v oficiálnych štatistikách uvádzaných 3801 umrti.. viete to aktualizovať ak aby to zodpovedalo s oficiálnymi informáciami..

podla najvaciesho odbornika na Analyzy dat bolo v tomto Plosnom testovani vykonanych:
95 558 testov
Pocet pozitivnych spolu: 2 329

avsak vo Vasom source: OpenData_Slovakia_Covid_AgTests_District.csv
mate toto:

co je diametralne vzdialene od vysledkov menovanych hore

Znamena to:

• ze bude zase ina tabulka na vstupy k vysledkom?
• alebo to doplnite o niekolko dni neskor (uz preslo vela dni)?
• alebo treba hodit Vase data do skartovacky pretoze su absolutne nekonzistene?

Uvedomuje si v tomto state niekto, ze na zaklade zlych dat sa tazko da nieco riadit? Zodpovednost za take rozhodnutia?

mate k dispozicii aj data o veku pacientov na UPV?
idealne dataset vo forme: AdmissionDate, Age, DischargeDate, Exitus(bool)

Dobrý deň, neplánujete zverejniť, po vzore Poľska alebo Rakúska, dáta o jednotlivých dodávkach vakcín, spolu s počtom doručených vakcín?

Dobry den, nenasla som v najnovsom subore s PCR testami podla districtov datum 23.12. velmi pekne dakujem za pomoc

Since I see that there were deaths on the 25. December listed here, but none reported on that day, is correct to understand that this file lists the actual date of each death, rather than date of report?

Will there be an update to this data?

Also, in the aggregate data that is being kept up to date, why aren't deaths "with" COVID being included, as they were in the aggregate file OpenData_Slovakia_Covid_DeathsCumulative.csv?

neuvazujete to trosku sprehladnit do foldrov? napr. : Testing, Hospitals, Vaccination, Deaths, Automat
vdaka za data

Dobrý deň

1. Všimol som si, že 9.2.2021; Nitra; Fakultná nemocnica nemá vyplnené dáta. a tak isto sú tam záznamy NA ktoré začali pribúdať od 18.1.2021.
2. Chcel by som sa spýtať, či je možné rozdeliť aj vyliečených podľa vzoru PositiveTests_AgeGroup_District?
3. Existujú záznamy ohľadne vyliečených z AG testov, alebo pozitívny odbúdajú (vyliečili sa) podľa počtov spred 10 dní? Dá sa to zistiť prosím?

Ďakujem za odpoveď.

Vraj sa rutinne robia pri RT PCR aj Ct values hodnoty. Dalo by sa pridat prosim ako stlpec pre PCR dataset district_age_gender?

tento dataset konci 11.11., asi nepodareny upload, skuste kludne excely radsej ako csv ked su take problemy csv

Hi, Thanks for your work!
We are using your data in this project https://github.com/sociepy/covid19-vaccination-subnational, which gathers regional data at a global scale, and we detected that there haven't been any updates for Slovakia since 2021-01-26. Is it a known issue?

I have seen your warning on the 26th on your README, pointing to possible uncomplete/error-prone data, but I am not sure I understand it.

Thanks for your time!

ak by sa dalo jednoducho pridat novy dataset csv ako je tento na cele SK:
https://mapa.covid.chat/export/csv
ale spravit to na okresy (prip. aspon kraje) , to by nemal byt velky problem. vdaka vopred!

Neviem to zatial so ziadnym encoding nacitat s diakritikou. Co je to prosim za encoding?
inak tento subor ma rozdelene okresy KE a BA, a co mate dataset pre PCR : OpenData_Slovakia_Covid_PositiveTests_AgeGroup_District.csv
tak tam mate KE a BA ako jeden okres. Ako da sa to ucesanim post process dat dokopy.

Ahoj,

uvazujete ze by ste uvadzali data ako pri PCR testoch? dakujem

Zdravim, bolo by mozne niekde publikovat udaje o pozitivnych na urovni okresov podla toho, ci sa jednalo o samoplatcu alebo indikovaneho pacienta? Mame vobec tieto udaje? Myslim, ze by to bola vyrazna pomoc hlavne pri hodnoteni TPR (Tests to Positive Ratio). Samozrejme by to chcelo niekde aj pocet testov rozdelenych podla tohto parametru.

ahojte chalani z IZA, mate nejako automatizovane updaty a budu updaty pocas sviatkov? alebo sa to robi manualne a teda otazka kedy mozeme ocakavat updaty pocas sviatkov?
P.S.: Stastne a vesele vianoce a SNR 2021 ;)

Pri premenovani a pridavani stlpcov v DailyStats, zmizol stlpec "Pocty vyliecenych". Umysel, alebo chyba? Inde som to nenasiel...

Na základe medializovaných informácií boli v bližšie nešpecifikovaných dátumoch duplicitne hlásené vykonané a pozitívne antigénové testy. Otváram preto issue, keďže predpokladám, že sa tieto nesprávne údaje dostali aj do týchto otvorených dát, ktoré nie je možné vzhľadom na štruktúru očistiť bez zásahu zodpovednej inštitúcie.

Dobrý deň
Predtým sa do tejto tabulky dávalo 8 stĺpcov a odrazu ich je len 6. chýba tam počet vyliečených a počet aktívnych.
Dá sa to uvádzať opäť?
Ďakujem.

Dobrý deň,

prosím opravte záporné dáta z 22.1.2021.

Ďakujem

chlapi, dajte vediet v anoucemente, ze menite kodovanie z jedneho dna na druhy, vid dnesne z Win1250 na UTF-8, konkretne dnes v suboroch:
OpenData_Slovakia_Covid_PositiveTests_District.csv
OpenData_Slovakia_Covid_PositiveTests_AgeGroup_District.csv
atd ...
aj to patri ku dobrej praci

inak vdaka za aktualizacie

V dátach Ag testov je kopec anomálií. Námatkovo vyberám:
8.2.2021 Bratislava V 68248 testov. Pritom druhý najvyšší počet testov je 9026 z 21.12.2020. To je nejaký sumár nezaevidovaných testov za celý január?
10.2.2021 Komárno 40346 testov. Doterajšie maximum bolo necelých 10 tis. 23.1. - sobota počas plošného skríningu.
8.2.2021 Turčianske Teplice 26418 testov. Za celý víkend 23.-24.1. prvého kola skríningu tam je evidovaná asi polovica testov.
9.2.2021 Trebišov 18385 testov. Ide o pracovný deň, keď sa testuje iste menej. Pritom za celý skríningový víkend 23.-24.1. je evidovaných spolu 14392 testov.

Predpokladám, že tieto čísla vstupujú aj do vyhodnocovania okresov v COVID automate, preto by mali byť správne.

Dobry den, udaje o pocte hospitalizacii nekoresponduju z udajmi NCZI. Je toho viacej ale napr okres Presov 10.11. mali hospitalizovanych 103 pacientov podla NCZI a 208 podla vasich dat. Dakujem.

Za víkend je tam asi 0,56M testov, pritom len za sobotu bolo reportovaných 1,3M. Takže do úplných dát chýba ešte veľmi veľa.

dalo by sa relevantne data sety nastavit raz denne refresh do githubu please?

Dobry den,
v prvom rade som nesmierne stastny ze vznika iniciativa na verejne dostupne a strohjovo citatelne data. Dakujem.

Vo svojom volnom case, ako dennu rutinu, od zaciatku pandemie zbieram data i ja kedze neboli a stale nie su rozumne pristupne. Zaroven som vytvoril blog post a jednoduchy dashboar o ktorom som hovoril aj na verejnom meetupe s pouzitim kokretnej technologie.

Rad by som privital okrem dennych aktualizovanych (strohjovo citatelnych) dat, aj API ktore by bolo pristupne na dalsie jednoduche spracovanie.
Lepsia granularita dat by sa iste hodila mnohym analytikom na vytvaranie zaujimavych vizualizacii, analyz a vzdelevanie.
Obce, Muzi vs zeny, pripadne vek.

Rad sa podelim o skusenosti, radosti a bole analyzy dat.

Vdaka!

je tam (asi) chyba v datasete:
19.11.2020;Muz;Liptovsky Mikulas;995

Napriek tomu, že vláda vyhlásila už finálne výsledky a upravila aj vlastné uznesenie so zoznamom okresov, stále nie je zrejmé, z akých zdrojových dát sa k výsledkom dopracovala. Dennými aktualizáciami tu pribúdajú údaje o Ag testoch za ďalšie a ďalšie dni, ale údaje za víkend masívneho testovania 23.-24.1.2021 sú stále nekompletné. V priloženom obrázku som zvýraznil zopár okresov, kde dáta zjavne chýbajú za jeden alebo aj oba dni. Je nejaká predstava, kedy budú dáta kompletné?

Neviem do akej miery siaha táto chyba, ale keď pozerám na Ag testy, tak pre okres Šaľa sa tam vyskytujú strašne nízke čísla, z vlastnej skúsenosti nerealistické. Okrem toho dáta zo Šale sú napr. 1.12.2020 a ďalšie až potom 14.12.2020 pričom sa jedná o jednotky ľudí. Odkiaľ vzniká tento problém a do akej miery zasahuje validitu dát?

https://github.com/Institut-Zdravotnych-Analyz/covid19-data/blob/main/OpenData_Slovakia_Covid_AgTests_District.xlsx

srdecna vdaka za datasety, takto sa to ma robit, palec hore, uz narychlo som si spravil aj PBI report so 7d incidenciou na 10000 obyv. , vdaka moc!

Hello, firstly thanks for all datas and i want to ask why you changed previous datasets? There was nice daily stats with new cases, tests, recovered and acitve cases but now i can not find it ... thanks for info

Could you provide some information or references on the methodology behind the number of recovered patients statistics?
I was not able to find any details on this from http://www.nczisk.sk, which seems to be the source of the data.

Could you please switch in CSV files to comma separator? All standard tool usually expect coma in CSV(Comma separated values).

Aka je metodika pri evaluacii PCR a AG testov z pohladu zaznamov o pozitivnych v okrese:

1. do prislusneho okresu sa pocita akakolvek osoba, ktora mala test v takom okrese (bez ohladu na trvaly pobyt osoby). Priklad: obcan z Popradu testovany v Ziline sa zapocita do zaznamov v Ziline.

alebo

2. do prislusneho okresu sa pocita osoba, ktora ma trvaly pobyt v takom okrese (aj ked bol test v inom okrese).
   Priklad: obcan z Popradu testovany v Ziline sa zapocita do zaznamov v Poprade.

V principe nie su vobec zverejnovane metodiky zberu dat, co je voda na mlyn k (ne)dovere v data.

Ku datam z okresu chyba nejaky dobry zdroj poctu vykonanych testov ako doplnenie OpenData_Slovakia_Covid_PositiveTests_AgeGroup_District.xlsx.

Vedeli by ste doplnit pocet vykonanych testov?

PS: Ku spominanemu datasetu OpenData_Slovakia_Covid_PositiveTests_AgeGroup_District.xlsx su tam uvadzani aj ludia s iba pozitivnym Ag testom?

Zdravim,

bolo by super keby sa datasety - hlavne AG testov, aktualizovali rovnako casto ako tie z PCR. Pouzivam csv z korona.gov, no to neobsahuje AG testy.

K datasetu OpenData_Slovakia_Covid_PositiveTests_AgeGroup_District.csv by prosím bolo možné doplniť parametre "dátum nazakenia", "stav prípadu" (cca. v zmysle "chorý / vyliečený / smrť") a "dátum uzavretia prípadu". Ak si dobre pamätám, tieto parametre sa aj vykazujú pre ECDC, čiže v evidencii by mali byť.
Podstatne by to pomohlo zlepšiť schopnosť modelovania v akom stave sa asi nachádzame. Príklad: predlžovanie času medzi dňom nakazenia a dňom pozitívneho testu signalizuje zhoršenie trasovania.

Dobrý deň.
V Covid_PositiveTests_AgeGroup nie je dátum 29.12.2020 a OpenData_Slovakia_Covid_Hospital_Details nie je update už 15dní.
Ďakujem

v datasete OpenData_Slovakia_Covid_PositiveTests_AgeGroup_District.xlsx chyba cely den 8.1.2021

Pozdravujem, v kontexte prechodu celej covid19 situácie do novej éry dostupnosti vakcíny by bolo super začať zberať údaje o zaočkovanej populácii. Samozrejme, najlepšie by bolo čo najdetailnejšie (okres, pohlavie, vek, a pod.), ale na začiatok budú dobré akékoľvek čísla naznačujúce aktuálny stav s očkovaním. Určite z nich budú môcť vzniknúť zaujímavé analýzy.

Dobrý deň.
Ešte nie sú k dispozícii dáta do konca decembra?
Ďakujem

Ste si istí správnosťou dát za 21.01.2021 okres Stará Ľubovňa? Pozitivita 65% je trochu neštandardná.

Edit: Aj okres Brezno má za tento deň pozitivitu vymykajúcu sa z trendu.