按清华大学2023春生物信息学课程的要求,创建此仓库以备份相关文件。
该仓库存放了我学习该课程时完成的所有作业以供参考。
鲁志老师的课程详情见此链接。
如有疑问或意见请发送邮件联系:[email protected]
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2023年2月27日
上传 HW1 文件夹,作业内容为
- Getting strated
- I.1.1 docker
- I.2.1 Basic Command
分别对应文件为
- lecture_1.md
- docker_usage.mp4
- linux_command.md
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2023年3月3日
上传 OL1 文件夹,作业内容为
- I.2.2 Practice Guide 上机部分
上传 HW2 文件夹,作业内容为
- I.2.2 Practice Guide 课后部分
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2023年3月14日
上传 HW3 文件夹,作业内容为
- II.1 BLAST
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2023年3月16日
上传 OL2 文件夹,作业内容为
- I.2.3 Linux Bash
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2023年3月31日
上传 HW4 文件夹,作业内容为
- III.1 Mapping
- III.1.1 Genome Browser
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2023年4月4日
上传 HW5 文件夹,作业内容为
- III.1.2 bedtools and samtools
- Appendix VI. Genome Annotations
分别对应文件为:
- samtools and bedtools.md
- Genome Annotations.md
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2023年4月6日
上传 OL3 文件夹,作业内容为
- I.3.1 R basics
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2023年4月21日
上传 HW6 文件夹,作业内容为
- III.2.1 Expression Matrix
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2023年4月24日
上传 OL4 文件夹,作业内容为
- I.3.2 Plot with R
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2023年5月1日
上传 HW7 文件夹,作业内容为
- II.3.1 GO
- II.3.2 KEGG
- III.2.3 Diffential Expression with DESeq2 and edgeR
分别对应文件为:
- GO.md
- KEGG.md
- Diffential Expression with DESeq2 and edgeR.md
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2023年5月20日
上传 HW8 文件夹,作业内容为
- III.3 ChIP-seq
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2023年5月25日
上传 OL5 文件夹,作业内容为
- IV.1.5 Performance Evaluation
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2023年5月25日
上传 HW9 文件夹,作业内容为
- IV.3 Machine Learning with Python
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2023年6月6日
上传 HMMbasic 文件夹,完成大作业