按清华大学2023春生物信息学课程的要求，创建此仓库以备份相关文件。
该仓库存放了我学习该课程时完成的所有作业以供参考。
鲁志老师的课程详情见此链接。
如有疑问或意见请发送邮件联系：[email protected]

• 2023年2月27日

  上传 HW1 文件夹，作业内容为

  • Getting strated
  • I.1.1 docker
  • I.2.1 Basic Command

  分别对应文件为

  • lecture_1.md
  • docker_usage.mp4
  • linux_command.md

• 2023年3月3日

  上传 OL1 文件夹，作业内容为

  • I.2.2 Practice Guide 上机部分

  上传 HW2 文件夹，作业内容为

  • I.2.2 Practice Guide 课后部分

• 2023年3月14日

  上传 HW3 文件夹，作业内容为

  • II.1 BLAST

• 2023年3月16日

  上传 OL2 文件夹，作业内容为

  • I.2.3 Linux Bash

• 2023年3月31日

  上传 HW4 文件夹，作业内容为

  • III.1 Mapping
  • III.1.1 Genome Browser

• 2023年4月4日

  上传 HW5 文件夹，作业内容为

  • III.1.2 bedtools and samtools
  • Appendix VI. Genome Annotations

  分别对应文件为：

  • samtools and bedtools.md
  • Genome Annotations.md

• 2023年4月6日

  上传 OL3 文件夹，作业内容为

  • I.3.1 R basics

• 2023年4月21日

  上传 HW6 文件夹，作业内容为

  • III.2.1 Expression Matrix

• 2023年4月24日

  上传 OL4 文件夹，作业内容为

  • I.3.2 Plot with R

• 2023年5月1日

  上传 HW7 文件夹，作业内容为

  • II.3.1 GO
  • II.3.2 KEGG
  • III.2.3 Diffential Expression with DESeq2 and edgeR

  分别对应文件为：

  • GO.md
  • KEGG.md
  • Diffential Expression with DESeq2 and edgeR.md

• 2023年5月20日

  上传 HW8 文件夹，作业内容为

  • III.3 ChIP-seq

• 2023年5月25日

  上传 OL5 文件夹，作业内容为

  • IV.1.5 Performance Evaluation

• 2023年5月25日

  上传 HW9 文件夹，作业内容为

  • IV.3 Machine Learning with Python

• 2023年6月6日

  上传 HMMbasic 文件夹，完成大作业