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rfishow's Introduction

RFIShow

  • 项目介绍: RFIShow软件致力于打造为一个对FAST数据进行聚类可视化分析的软件,为用户提供FAST数据分析、RFI检测分析、RFI连通块聚类分析等功能。具体如下:
    1. 可视化FAST数据,并且支持局部区域数据的放大显示;
    2. 对FAST数据进行RFI检测、调参与分析;
    3. 提取RFI连通块特征数据;
    4. 对RFI连通块数据集进行批量分析:降维、聚类、分类器剔除等;
    5. 支持导出中间测试结果数据;
    6. 提供API接口供高级用户使用;
    7. ...
  • 项目负责人: 熊盛春

一、功能介绍

1.1 RFI检测分析

功能:读取FAST文件中的数据进行可视化,并提供一个交互式的界面便于用户实现对RFI的检测参数调节以及RFI特征提取的参数调节。

RFI特征包括

x:		起始位置,时间点
y:		起始位置,频率
bandwidth:	带宽
duration:	持续时间
data_mean:	强度均值
data_var:	强度方差
  • 参数设置:FAST文件、RFI检测算法、RFI特征提取的参数设置
    • FAST文件设置:选中文件、数据块编号、极化通道。
    • RFI检测算法的选择:提供各种RFI mask检测算法供用户选择使用,支持在线交互参数的调节。
      • arpls_mask
      • st_mask
      • template_mask:用户自定义RFI检测,需要按照一个的格式存放于指定位置。(参考/core/mitigation/TemplateMask存放于/core/mitigation路径下)
    • 显示参数设置
      • 是否显示条状mask
      • 是否显示点状mask
      • 视野尺寸
    • 特征检测算法设置:
      • 连通计算算法设置:4连通、8连通。
  • 保存当前检测结果:含图片数据、RFI mask矩阵数据、RFI特征数据。
  • RFI检测:按选定的参数对数据进行RFI检测。
    • 显示RFI检测结果。
    • 动态显示局部数据图像。
  • RFI特征提取:
    • 显示RFI特征提取的表格结果。
    • 动态显示选定特征局部数据图像。
    • 排序表格。
  • 其他
    • 批量进行RFI检测。
    • 批量进行RFI特征提取。

1.2 RFI聚类分析

功能:采用了析取的方法对提取的RFI特征进行聚类分析,并可视化聚类的结果。

  • 参数设置
    • 选择RFI特征数据的文件。
    • 是否剔除单点状RFI样本。
    • RFI特征采用t-SNE降维的的参数调节。
    • 提供各种RFI特征的聚类的方法选择,及在线参数调节。
      • KMeans
      • AgglomerativeClustering
      • GaussianMixture
      • DBSCAN
      • 用户自定义
    • 聚类个数K值的确定。
  • 显示聚类结果与局部RFI可视化
    • 实现点击聚类样本点实时显示局部RFI数据。
    • 实现显示局部RFI数据的视野调节。
    • 显示统计数据分析。
    • 查询记录(记录用户点击查询的数据,便于用户的对比)。
    • 导出查询记录。
    • 导出选中聚类区域样本数据。
  • 其他
    • 能够保存退出前数据降维的结果,避免重复运算。

1.3 其他

功能:软件的一些其他功能

  • 保存用户退出程序前的指定的参数信息(可以避免每次打开软件重复性的参数设置)。
  • ...

二、依赖包

scipy==1.5.3
numpy==1.19.4
pandas==1.1.4
astropy==2.0.16
scikit-learn==0.23.2
scikit-image=0.17.2
matplotlib==3.3.2
pyqt5==5.15.2

三、启动使用

$ python main.py

四、文件架构介绍

  • bin:存放脱离界面的一些可单独执行的功能包。
  • conf:存放环境和用户相关的配置文件。
  • core:存放核心功能代码。
  • data:存放相关检测数据、临时文件和日志文件。
    • FAST_data:存放fast数据(未上传)。
    • log:存放日志文件。
    • temp_data:存放中间临时文件。
  • resource:存放UI界面相关资源文件(未上传)。
  • test:存放模块测试代码。
  • ui:存放界面相关代码。
  • main.py: 软件启动函数

五、版本记录

  • ~2021.4.14---v0.0
    1. 初步完成RFI特征提取、RFI特征聚类的相关代码。
    2. 搭建UI界面整体架构。
    3. 搭建RFI聚类可视化界面。
    4. 实现点击聚类样本点实时显示局部RFI数据。
    5. 实现显示局部RFI数据的视野调节。
  • ~2021.4.21---v0.1:
    1. 抽象重构RFI特征提取、RFI特征聚类相关核心代码。
    2. 主界面添加了一个gif动画。
    3. 搭建RFI检测界面以及参数设置子界面。
    4. 实现交互式的RFI检测算法选择和参数设置。
    5. 实现当前检测结果的保存(保存检测可视化图片与RFI mask矩阵)。
    6. 添加环境和用户配置相关文件,并可保存用户上传退出时的参数设置。
  • ~2021.4.28---v0.2:
    1. 将RFI特征提取功能合并到RFI检测与分析中。
    2. RFI检测分析中的参数设置界面加入极化通道、视野尺寸以及特征提取连通算法等的参数设置。
    3. RFI检测分析中加入动态显示局部RFI检测结果图像的功能。
    4. RFI检测分析中加入特征提取后部分表格数据的可视化,并具有动态显示所选定的局部数据图像。
    5. 优化RFI局部显示的代码,几乎不用等待。
  • ~2021.5.11---v0.3:
    1. 实现表格数据排序的功能。
    2. 重构RFI聚类分析界面,包括一个主显示,两个副显示,已经5个功能按键(参数设置、切换显示、特征降维、特征聚类、保存结果)。
    3. 加入了一个切换显示功能,能够切换显示聚类类别统计信息和RFI局部显示信息。
  • ~2021.5.18---v0.4:
    1. 增加了DBSCAN聚类方法。
    2. 加入了鼠标框选导出样本数据的功能。
    3. 加入了点击某一类别时隐藏其他类别的功能。

六、界面演示

6.1 主界面

RFIShow/main_page.png at master · Chan-0312/RFIShow (github.com)

6.2 RFI检测分析界面

RFIShow/detect_page_1.png at master · Chan-0312/RFIShow (github.com)

6.3 RFI聚类分析界面

RFIShow/cluster_page_1.png at master · Chan-0312/RFIShow (github.com)

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