Code Monkey home page Code Monkey logo

msc-advanced-statistical-analysis-project's Introduction

Projet-ASA

Présentation du projet

Collaborateurs : Bastien Clémot, Raphaëlle Lebailly, Chloé Pérou, Pierre-Alexandre Quittet

Projet de groupe pour l'UE 'Advanced Statistical Analysis' dans le cadre du Master 2 MODE (Modélisation en Ecologie).

Manipulation d'un tableau de données sur l'étude de l'effet du génotype, du métabolisme et des conditions environnementales sur les conditions thermiques du vol des papillons. L'espèce de papillon est Melitaeria cinxia, étudiée dans des conditions semi-naturelle dans des cages extérieures. On s'intéresse à la température des papillons lors du vol sous 3 aspects :

  • Métabolisme
  • Conditions environnementales
  • Génétique : gènes candidats de réponses au stress

Nous nous attendons à voir un effet de ces trois types de variables, en particulier de gènes. En effet, selon la littérature :

  • Un génotype 'AC' pour SNP 331 est associé à de plus grandes performances métaboliques à une faible température corporelle
  • Un génotype 'AA' pour SNP 331 est associé avec un faible taux métabolique durant le vol à température moyenne mais de bonnes performances pour de fortes températures
  • Des différences d'expression de la Heat shock protein sur la protéine gpi

Organisation des fichiers

  • ASA_PROJECT_SCRIPT_MD.Rmd : fichier RMarkdown avec les analyses complètes
  • ASA_PROJECT_SCRIPT_MD.html : fichier htlm avec les analyses complètes
  • ASA_data_projet.txt : Tableau de données à analyser sous format texte
  • data_butterfly.xlsx : Tableau de données à analyser sous format excel
  • Article_data_Mattila_2015.pdf : pdf de l'article sur lequel se base l'étude

msc-advanced-statistical-analysis-project's People

Contributors

bclemot-sc avatar cperou avatar paquittet avatar rlebailly avatar

Stargazers

 avatar  avatar  avatar

Watchers

 avatar

Recommend Projects

  • React photo React

    A declarative, efficient, and flexible JavaScript library for building user interfaces.

  • Vue.js photo Vue.js

    🖖 Vue.js is a progressive, incrementally-adoptable JavaScript framework for building UI on the web.

  • Typescript photo Typescript

    TypeScript is a superset of JavaScript that compiles to clean JavaScript output.

  • TensorFlow photo TensorFlow

    An Open Source Machine Learning Framework for Everyone

  • Django photo Django

    The Web framework for perfectionists with deadlines.

  • D3 photo D3

    Bring data to life with SVG, Canvas and HTML. 📊📈🎉

Recommend Topics

  • javascript

    JavaScript (JS) is a lightweight interpreted programming language with first-class functions.

  • web

    Some thing interesting about web. New door for the world.

  • server

    A server is a program made to process requests and deliver data to clients.

  • Machine learning

    Machine learning is a way of modeling and interpreting data that allows a piece of software to respond intelligently.

  • Game

    Some thing interesting about game, make everyone happy.

Recommend Org

  • Facebook photo Facebook

    We are working to build community through open source technology. NB: members must have two-factor auth.

  • Microsoft photo Microsoft

    Open source projects and samples from Microsoft.

  • Google photo Google

    Google ❤️ Open Source for everyone.

  • D3 photo D3

    Data-Driven Documents codes.