auto_umbr_frame.py – генерирование файла зависимости расстояния (COM) от t и автоматическая фильтрация конформаций для окон umbrella sampling (US)

chain_trjpdb.py – переименование цепей с перенумерацией а.о. в pdb-файле

chain_trjpdb_tk.py – tk версия chain_trjpdb.py

conf_rename.py – перенумерация конформаций US

creat_xvg.py – генерация xvg- файлов по результатам US

dna_srg.py – генерирование случайной первичной последовательности ДНК

dna_srg_tk.py - tk версия dna_srg.py

gro_conv.py - конвертер gro-файлов ProDrug-сервера

hcheck.py - утилита для проверки валентных связей H-атомов в структуре

multigraph_tk.py – отображение на графике данных одного или нескольких xvg-файлов — аналог xgrace

ocucheck.py – проверка суммы заселенностей атомов и а.о. в pdb-файле

occucheck2.py - проверка суммы заселенностей атомов и а.о. (biopython)

occucheck2_tk.py - проверка суммы заселенностей атомов и а.о.

setb.py - установка значения B-фактора заданному диапазону а.о.

setb_tk.py - tk версия setb.py

split_chain.py - разделение pdb-файла по отдельным цепям

auto_umbr_frame.py – numpy, matplotlib, progressbar

creat_xvg.py – numpy

histo.py – numpy, matplotlib

multigraph_tk.py – numpy, matplotlib

occucheck2.py – biopython, numpy, mmtf